As atividades de auditoria visam uma revisão das demonstrações financeiras, sistema financeiro, registros, transações e operações de uma entidade ou de um projeto, com a finalidade de assegurar a fidelidade dos registros e proporcionar credibilidade às demonstrações financeiras e outros relatórios da administração, podendo propor critérios e recomendações para melhorá-los.
A auditoria tanto na área pública quanto na área privada é uma especificidade da área contábil, cujo propósito primordial é atestar a validade de determinado dado, a detecção das disfunções do patrimônio, em decorrência de falhas na administração testando a eficiência e eficácia do controle patrimonial.
As atividades desta Controladoria tem como escopo de trabalho propor critérios de controles administrativos, monitorar o cumprimento das determinações legais e normas administrativas, realizar verificações nos processos de gestão de operações, avaliar a integridade e segurança das operações e verificar a regularidade das atividades desenvolvidas pelas unidades do CPS, realizando estudo e propondo medidas de padronização de procedimentos, prestando informações aos órgãos de cúpula da Autarquia, bem como, aos órgãos de controle externo.
Assim, podemos concluir que as atividades de auditoria têm como função revisar processos, enquanto a Controladoria Interna busca padronizar os procedimentos de acordo com as determinações legais e administrativas.